糞、尿不混合分別收集，尿不要流入貯糞池，糞、尿分別處理、分別利用，是設計糞尿分集式生態衛生廁所的基本要求。在掌握了基本的原理后，設計可以有很大的變動，以適應不同的需要。

　　覆蓋料的選擇與糞便無害化

　　覆蓋料的選擇要依照因地制宜的原則,不可照搬他人的經驗。我們推薦下列物資作為覆蓋料：草木灰、生石灰、生石灰/爐灰、生石灰/沙土、鋸末/黃土、谷殼/黃土等，各地可依據自己的資源進行篩選。不同覆蓋料糞便無害化效果：

　　草木灰：糞便無害化需要2~3個月

　　細黃（沙）土：糞便無害化需要9個月

　　細爐灰：糞便無害化需要9個月

　　細鋸末：糞便無害化需要9個月

　　石灰復合覆蓋物：糞便無害化需要3~6個月

　　糞尿分集式生態衛生廁所的建筑結構與其它衛生廁所相同，由維護結構（廁屋）、儲糞結構和一個糞尿分流的便器組成；可能時單修個男士小便池，與尿收集器接通。其儲糞結構可建在半地面或地面上。

　　只要堅持糞尿分集（分流）、便后加灰，利用干燥或發酵的原理使糞便無害化，就可因地制宜自行設計好的糞尿分集式衛生戶廁。

　　糞尿分集式生態廁所的“生態”，包括兩個層次：一是原理上實行糞尿分集，不用水沖，既干凈衛生，又節約水資源，糞尿無害化后，又可支持當地的生態農業，如何實現兩個層次的“生態”，很大程度要同時考慮材料與人工（時間）成本，如果通過優化方案能達到既節約成本又實現生態環保的理念，那當然好了。