目前的生態廁所使用率很多的是微生物菌種分解糞便的廁所，利用其生長繁殖活動對糞便中可利用的大分子有機化合物進行生物降解并轉化為菌體生物量，競爭性的抑制并殺死糞便中的病原性微生物，吸附、降解、轉化糞便中產生的臭味物質，實現了糞便的無害化、資源化處理。能達到零排放的功能。

　　生態環保廁所可分為：生態環保廁所、生物廁所、微生物廁所、干式攪拌廁所等等。

　　生態環保廁所是在國外引進機的基礎上模仿而成的，特征是糞尿直入主機，進行生物處理。特征是糞尿分離，大便直入主機，進行生物處理；小便引出主機進入其它系統處理排放。

　　生態環保廁所按用途不同可分為：免沖生態廁所、水沖生態廁所、循環沖生態廁所、太陽能免沖生態廁所、手搖生態廁所等。

　　生態廁所功能：

　　⑴糞污無害化

　　糞尿中含有大量的有機物、惡臭及致病微生物，通過環境工程等手段，使這些污染物得到妥善處理，將糞污無害化，在達到環境許可的條件后，排入周圍環境，不對環境造成破壞。

　　⑵糞污資源化

　　糞污中含有大量的有機物和豐富的N、P、K等肥效成份。通過特殊的處理回收手段，在糞尿無害化的同時，回收其中有效成份。是制肥是主要利用手段之一。另一個重要方面是回收糞尿中的水份。糞尿中70%以上是水份，通過處理，可以使這些污水達到很高的水質標準，甚至可以供人飲用。

　　生態環保廁所不僅可以建成固定式的結構。因此具有可移動的特點，是移動型和臨時廁所的先選擇。生態廁所在使用功能上與傳統廁所相同，增加的凈化單元不僅可以與新型廁所組成一個有機整體，而且可以用在現有廁所的改造和更新上，凈化處理單元與現有廁所可以很方便地結合起來，實現現有廁所的升級換代。